https://github.com/jakzal/phpqa вот это ольшой интегрированный пакет с кучей утилит. С ним можно на on[push] проверять синтаксис. На merge генерить документацию (правда не факт ,что документация нужна вида все докблоки, но пока нет никакой можно подумать что нужно. Как минимум опробовать и решить. (А еще подумать как это интегрировать с вики в нашей системе)